・学校の監督責任
硬式野球部が実績により学校内で特別な地位を有していて、元監督の発言力も強かったため、経営陣が同部の指導体制や寮生活、ハラスメント防止体制の監督を十分に怠って長期間放置していた。

・発覚後の学校対応の問題点
学校はいじめと認識せず、通常の生徒指導事案として組織的な対応を怠った。また、主張が対立しているにもかかわらず、個別の部屋が設けられない状態での聴取にとどまり、Ａ本人からの十分な聴取や追加調査を行わないまま実態把握を不十分に終えた。結果として事案を過小に取り扱った不祥事報告書を高野連へ提出した。学校としての正式な意思決定を経ず、元監督ら野球部指導者を中心に保護者対応が行われたため、組織としての一貫性を欠き保護者の不信感を増幅させた。