JR九州では長崎本線などで大雨の影響で始発からダイヤが大幅に乱れています。
JR九州のwebサイトによりますと、下記のようになっています。

＜大雨によるダイヤ乱れ＞（17時24分現在）

●西九州新幹線（上下線）遅れが発生【遅延:武雄温泉から長崎】

●長崎本線（上下線）遅れが発生【遅延:鳥栖から肥前浜】

●佐世保線（上下線）遅れが発生【遅延:江北から佐世保】

＜大雨に伴う運行状況について＞（17時18分現在）

●長崎本線（上下線）
鳥栖～肥前浜間:本数を減らして運行しています。
肥前浜～諫早間:終日、運行を取り止めています。
諫早～長崎間:本数を減らして運行しています。

●佐世保線（上下線）
江北～佐世保間:本数を減らして運行しています。

特急列車の運休（17時18分更新）

かささぎ108号肥前鹿島～博多
みどり35号博多～佐世保
ハウステンボス40号ハウステンボス～博多

大雨に伴う運行状況について

●大村線（上下線）
早岐～諫早間:本数を減らして運行しています。